Biyoteknoloji Çalışma Grubu
Araştırmacılar:
Esra Mine Ünal, Işılay Çelik, Pelin Taş, Ayça Deniz, Ayşegül Er Gökçe, Berkay Gülen, Ayça Yeşilbağ, Emre Keskin
#GenomikTeknolojiler #DNABarkodlama #Metabarkodlama #eDNA #TarımsalKimliklendirme #EndüstriyelUygulamalar #TarımdaDNA #GıdaGüvenliği #GenomProfilleme #AgronomikÖzellikler #Verimlilik #StresToleransı #ÇevreYönetimi #SürdürülebilirTarım #EkosistemSağlığı #DoğaDostuTeknolojiler
Grup, temel ve uygulamalı araştırmalarını modern genomik teknolojilerle birleştirerek sürdürülebilirliği destekleyen biyoteknolojik ürünler geliştirmektedir. Grup, tarımsal ürünlerin kimliklendirilmesi, bitki ve hayvan türlerinin genetik doğrulaması ve biyolojik kaynakların izlenebilirliğini sağlamak amacıyla DNA barkodlama teknolojilerini endüstriyel uygulamalara entegre etmektedir. Tarım ve gıda sektörlerinde sahtecilikle mücadele, biyoçeşitlilik izleme ve tarımsal ürün sertifikasyonu gibi kritik süreçlere yönelik DNA barkodlama tabanlı analiz sistemleri geliştirilmekte ve uygulamaya geçirilmektedir. Grup, özellikle genetik çeşitliliğin belirlenmesi, bitki ve mikroorganizmalarda verim ve stres toleransı gibi önemli agronomik özelliklerin araştırılması için genom profillendirme çalışmaları yürütmektedir. Bu veriler, biyoteknolojik ürünlerin üretim süreçlerine entegre edilerek daha dirençli ve verimli biyolojik sistemlerin oluşturulmasına katkı sağlamaktadır. Çevresel DNA (eDNA) metabarkodlama teknolojileri, biyolojik izleme ve çevre yönetimi süreçlerine destek vermek amacıyla endüstriyel ölçekli çevresel analizlerde kullanılmaktadır. Su kaynaklarının korunması, biyoçeşitlilik izleme, sucul ve karasal ekosistemlerdeki türlerin izlenmesi gibi çevresel sürdürülebilirlik projelerinde eDNA tabanlı biyoteknolojik çözümler geliştirilmektedir. Bu yöntemler, çevre dostu, hızlı ve maliyet etkin analizler sunarak ekosistem sağlığını izlemeye yönelik endüstriyel uygulamalara doğrudan entegre edilmektedir.
Tarım ve gıda biyoteknolojisi alanında, tarımsal ürünlerin genetik kimliklendirilmesi, gıda ürünlerinin orijin doğrulaması, bitki ve hayvan türlerinin genetik çeşitliliğinin belirlenmesi gibi kritik süreçlerde DNA barkodlama ve genom profilleme teknolojilerini aktif olarak kullanılır. Bu yaklaşımlar, özellikle sahtecilikle mücadele, gıda güvenliği, kalite kontrol, sürdürülebilirlik ve coğrafi işaretleme sistemlerinin güçlendirilmesinde önemli rol oynar. Gıda zincirinin her aşamasında genetik izlenebilirliğin sağlanması, hem tüketici sağlığını korumakta hem de üreticiye katma değer kazandırır.
Çevresel DNA (eDNA) ve metabarkodlama çalışmaları, çevre biyoteknolojisi ve çevresel izleme uygulamalarına entegre edilerek biyolojik çeşitliliğin korunmasına yönelik çözümler geliştirmektedir. Tatlı su ve deniz ekosistemlerinden alınan su örnekleri, toprak, hava, polen, hatta gıda matrisleri gibi çevresel örneklerde bulunan DNA’ları analiz edilerek; mikroorganizmalardan bitkilere ve hayvanlara kadar çok çeşitli organizmaların tespiti sağlar. Bu sayede biyoçeşitlilik izleme, istilacı türlerin takibi, habitat kalitesinin değerlendirilmesi ve ekosistem sağlığının izlenmesi gibi alanlarda çevre dostu, hızlı ve maliyet etkin biyoteknolojik çözümler sunar.
Grubun yürüttüğü genom profilleme çalışmaları, verim, stres toleransı, hastalıklara direnç gibi önemli agronomik özelliklerin belirlenmesine yöneliktir. Bu veriler, yeni nesil biyoteknolojik ürünlerin tasarımında ve üretim süreçlerinde kullanılarak daha dayanıklı, verimli ve sürdürülebilir biyolojik sistemlerin geliştirilmesine olanak tanır.
Biyoteknoloji Çalışma Grubu, endüstriyel ihtiyaçlara yanıt veren, çevreyle uyumlu ve bilimsel temelli çözümleriyle hem akademiye hem de sanayiye katkı sunar.
Çalışma Alanları
Genetik Mühendisliği Daha verimli, dirençli ve sürdürülebilir biyolojik sistemlerin geliştirilmesi
DNA Barkodlama ve Metabarkodlama
Bitki, hayvan ve mikroorganizmaların moleküler düzeyde tanımlanarak kimliklendirilmesi ve izlenebilirliğinin sağlanması.Gıda Biyoteknolojisi Gıda ürünlerinde orijin doğrulama, sahteciliğin tespiti ve kalite kontrol için moleküler analizlerin uygulanması.
Çevresel DNA (eDNA) Tabanlı İzleme
Su, toprak ve hava örneklerinden elde edilen DNA ile biyoçeşitlilik izleme ve ekosistem değerlendirme.Genomik ve Transkriptomik Analizler Organizmaların genetik yapısının ve gen ifade düzeylerinin yüksek çözünürlükle analiz edilmesi.
Biyoinformatik ve Veri Analizi
Yüksek boyutlu biyolojik verilerin analizi, yorumlanması ve yapay zekâ destekli karar destek sistemlerinin geliştirilmesi
Üniversite-Sanayi İş Birlikleri
Biyoteknolojik çözümlerin sanayiye aktarımı için uygulamalı projeler ve ortak Ar-Ge faaliyetleri yürütülmesi.
Projeler
Yapay Zeka Algoritmaları ile Çoklu Omik Veri Entegrasyonu
Çevresel Örneklerin Taksonomik Tanımlanmasında Havadan DNA (eDNAir) Metabarkodlama
Tr.Aqua: Gıda Arzı Güvenliği Çerçevesinde Su Ürünlerinde Yenilikçi Ve Sürdürülebilir Uygulamalar
Bandırma Körfezi Ve Çanakkale Boğazı'nda Müsilajın Su Kolonunda ve Deniz Tabanındaki Biyoçeşitliliğe Etkisinin Metabarkodlama ile Araştırılması ve Biyoizleme Belirteçlerinin Geliştirilmesi
“Su Saflaştırma Sistemlerinin Mikrobiyal Filtrasyon Etkinliği Üzerine Moleküler Bir Araştırma