
ekip lideri
Prof. Dr. Emre Keskin
#eDNAMetabarkodlama #MolekülerEkoloji #EvrimselGenetik #Metagenomik #EkstremEkosistemler #eKoGenomikEndeksleri #Biyoçeşitlilikİzleme #Genomikİnovasyon
Emre, moleküler ekoloji ve evrimsel genetik alanlarında uzmanlaşmış olup, Ankara Üniversitesi Evrimsel Genetik Laboratuvarı’nda araştırmalar yürütmekte ve AgriGenomics Hub’ın OCU Direktörlüğü’nü yapmaktadır. Çalışmalarını (e)DNA metabarkodlama ve metagenomik teknikler kullanarak ekstrem ekosistemlerdeki türlerin biyolojik izlenmesi ve yeni eko-genomik endekslerin geliştirilmesi üzerine yoğunlaştırmaktadır.
Emre Keskin, Ankara Üniversitesi Evrimsel Genetik Laboratuvarı'nda moleküler ekoloji ve evrimsel genetik alanlarında çalışmalarını sürdürmektedir. Aynı zamanda bölgenin en gelişmiş genomik altyapılarından biri olan AgriGenomics Hub: Hayvan ve Bitki Genomik Araştırma İnovasyon Merkezi’nin OCU Direktörüdür. Yüksek lisans ve doktora derecelerini Biyoteknoloji alanında almıştır. Doktorasını tamamladıktan sonra, birçok Avrupa Birliği bilimsel ağına katılmış ve Avrupa ekosistemlerinin biyolojik çeşitlilik değerlendirmeleri ve biyoizleme çalışmaları için altın standart genomik araçları ve yeni eko-genomik endeksleri ve ölçümleri belirleme hedefi ile çevresel DNA metabarkodlama kavramsal çerçevesinin geliştirilmesinde önemli bir rol oynamıştır.
Çalışmaları, ağırlıklı olarak ekstrem ekosistemlerdeki istilacı, nesli tükenmekte olan ve endemik türlerin biyolojik izlemelerine yönelik (e)DNA (meta)barkodlama ve metagenomik tekniklerin kullanılmasına odaklanmaktadır. Yayınlanmış uluslararası indekslerde taranan 60'tan fazla makalesi ve ulusal ve uluslararası toplantılarda 150'den fazla sunumu bulunmaktadır. Bugüne kadar 76 ulusal ve uluslararası projede yer almış, bu projelerin 17'sinde proje lideri olarak çalışmıştır.
Kurucusu olduğu biyoteknoloji şirketi tarafından geliştirilen yeni nesil eDNA Metabarkodlama Kiti, İngiliz Kraliyet Akademisi ve Newton Vakfı tarafından yapılan inovasyon projelerinin değerlendirilmesi sonrası ödüle layık görülerek ürün geliştirme anlamındaki çalışmaların başlangıcını oluşturmuştur.
Başta Birleşmiş Milletler IPBES, IUCN, iBOL ve BIOSCAN olmak üzere 6 farklı uluslararası kuruluşun çeşitli komisyonlarında üyelik yapan Emre Keskin, ulusal platformda Su Ürünleri Genetik Kaynakları Danışma Komisyonu, Su Ürünleri Araştırma Programları Değerlendirme Grubu ve Tarım ve Orman Bakanlığı Biyoçeşitlilik, Eğitim ve Yenilenebilir Enerji Çalışma Grubu üyesi olarak çalışmalarına devam etmektedir.
Projeler
*
AquaGenomik: Su Ürünleri Gıda Güvenliğinde Öneme Sahip Hedef Türlerin Tüm Genom-Transkriptom Dizilemesi ve Hücre Hatlarının Oluşturulması
*
Levrek Yetiştiriciliğinde Ulusal Islah Hatlarının Oluşturulması
*
LIFEPLAN
Diğer Projeler
Devam Eden
Türkiye’de Candida auris’in çevre, hayvan ve insan ilişkisinin tek sağlık bakış açısı ile araştırılması
Görevi: Araştırmacı, Destekleyen: TÜBİTAK 1001 124S746 (2024–2027)
Çanakkale’de Bir Kızılçam Orman Alanında Yangın Şiddetinin Toprak Bakteri ve Fungus Komüniteleri Üzerindeki Etkisi
Görevi: Araştırmacı, Destekleyen: TÜBİTAK 1002 124Z549 (2024–2025)
Çevresel Örneklerin Taksonomik Tanımlanmasında Havadan DNA (eDNAir) Metabarkodlama
Görevi: Danışman, Destekleyen: TÜBİTAK 1002 124Z433 (2024–2025)
Marnlı Habitatlarda Yetişen Dar Yayılışlı ve Yaygın Bitkilerin Polinatör Böcek Çeşitliliğinin eDNA Metabarkodlama Tekniği Kullanılarak Karşılaştırılması
Görevi: Araştırmacı, Destekleyen: TÜBİTAK 1002 124Z153 (2024–2025)
Hastane atık sularından Candida auris’in temizlenmesine yönelik mikovirüs aracılı çevre dostu biyomalzeme geliştirilmesi
Görevi: Araştırmacı, Destekleyen: Gazi Üniversitesi YÖK ADEP 9116 (2024–2026)
CRISPR/Cas9-Tabanlı Hücre-İçi RNA Mühendisliği Sistemi Geliştirilmesi ve Uygulaması
Görevi: Araştırmacı, Destekleyen: TÜBİTAK 1001 123Z765 (2023–2026)
Türkiye Tardigrat Türlerinin Moleküler ve Morfolojik olarak Tanımlanarak Genom Verilerinden Sürdürülebilir Tarım ve Tıp Alanında Faydalanılması
Görevi: Araştırmacı, Destekleyen: Ankara Üniversitesi BAP Öncelikli Alan FOA-2023-2669 (2023–2025)
TR.AQUA: Gıda Arzı Güvenliği Çerçevesinde Su Ürünlerinde Yenilikçi Ve Sürdürülebilir Uygulamalar
Görevi: Yönetici, Destekleyen: TÜBİTAK 1004 22AG009 (2023–2027)
