doktora adayı
Berkay Gülen
#YeniNesilDizilemeTeknolojileri #eDNA #Biyoinformatik #Metabarkodlama
Berkay, eDNA (çevrsel DNA), barkodlama, metabarkodlama ve yeni nesil dizileme (NGS) alanlarında çalışmalar yürütmektedir.
Berkay Gülen lisansını Hacettepe Üniversitesi Biyoloji bölümünde tamamlamıştır. Bu süreçte konuk araştırmacı olarak botanik anabilim dalında, genel biyoloji anabilim dalında, ekoloji ve genetik anabilim dallarında farklı yıllarda çalışmalar gerçekleştirmiştir. Başkent Üniversitesi Moleküler biyoloji ve Genetik bölümünde yaz stajını biyoinformatik üzerine gerçekleştirmiştir.
Yüksek lisans öğrenimine Ankara Üniversitesi Su Ürünleri bölümünde “Metabarkodlamanın Tür Seviyesinde Diatom Biyoizleme in vitro ve in silico Entegrasyonu” adlı yüksek lisans tezini tamamladıktan sonra, doktora sürecine Ankara Üniverstesi Su Ürünleri bölümünde devam etmektedir.
2019 yılından itibaren Evrimsel Genetik Laboratuvarı’nda (eGL) ve 2021 yılından itibaren Ankara Üniverstesi Gıda,Tarım ve Hayvancılık Teknokenti AgriGx (Agrigenomics Hub) laboratuvarında araştırmacı olarak yer almakta olup BTU (Biyomarker Translation Unit) sorumlusudur.
Projeler
*
Tr.Aqua: Gıda Arzı Güvenliği Çerçevesinde Su Ürünlerinde Yenilikçi Ve Sürdürülebilir Uygulamalar
*
Yapay Zeka Algoritmaları ile Çoklu Omik Veri Entegrasyonu
*
Agrigenomics Hub – Animal and Plant Genomics Research Innovation Center
*
Bandırma Körfezi ve Çanakkale Boğazı’nda Müsilajın Su Kolonunda ve Deniz Tabanındaki Biyoçesitlilige Etkisinin Metabarkodlama ile Araştırılması ve Biyoizleme Belirteçlerinin Geliştirilmesi
*
Yayınlar
A. Uluslararası Hakemli Dergilerde Yayımlanan Makaleler
A1. Gülen B, Keskin E. In vitro and in silico Integration of Metabarcoding into Species-Level Diatom Biomonitoring (Yayın aşamasında)
A2. Çelik I., Gülen B., Taş P., Geçgil G., Keskin E. Identifying Bacterial and Eukaryotic Communities Related to Marine Mucilage with eDNA Metabarcoding (Yayın aşamasında).
Bildiriler
B. Uluslararası bilimsel toplantılarda sunulan ve bildiri kitabında basılan bildiriler:
Sözlü Sunum
B1. Gülen B, Keskin E. In vitro and in silico integration of metabarcoding into species-level diatom Biomonitoring, ICDBB International Conference on DNA Barcoding Biodiversity 25-27 May 2022
B2. Geçgil G., Gülen B., Çelik I., Taş P., Keskin E. 2022. Molecular analysis of mucilage formation at Aegean Sea via metabarcoding. International Conference on DNA Barcoding and Biodiversity, 25-27 May 2022, Sofia, Bulgaria.
B3. Çelik I., Ünal E. M., Gülen B., Taş P., Keskin E. Detecting Toxic Species from Marine Mucilage Through Digital Droplet PCR. International Symposium of Fisheries and Aquatic Sciences (SOFAS) in Trabzon, 25-27 October 2022