doktora adayı
Metehan Arıkan
#Biyoinformatik #ÇokluOmik #MakineÖğrenmesi
Metehan'ın uzmanlık alanları arasında hesaplamalı biyoloji ve biyoinformatik bulunmaktadır.
Metehan Arıkan, Hacettepe Üniversitesi Biyoloji Bölümü 2018 mezunudur. Akademik kariyerine lisans eğitiminden sonra Ankara Üniversitesi Biyoteknoloji Enstitüsü'nde yüksek lisans ve doktora çalışmalarıyla devam etmektedir. Akademik ilgisi, hesaplamalı biyoloji ve biyoinformatik üzerine yoğunlaşmıştır. Makine öğrenmesi uygulamalarıyla çoklu omik veri entegrasyonu ve fenotip çıkarımları üzerine çalışmaktadır.
Metehan Arıkan, AgriGx’de Laboratuvar Koordinatörü ve Hesaplamalı Biyoloji Birimi (CBU) Sorumlusu olarak görev yapmaktadır. Bu pozisyonunda, laboratuvar süreçlerinin yönetimi ve hesaplamalı biyoloji alanındaki projelerin koordinasyonu gibi sorumlulukları üstlenmektedir.
AgriGx'deki görevi kapsamında laboratuvar süreçlerini yönetirken, eGL'deki araştırmacı rolüyle çoklu omik veri entegrasyonu ve makine öğrenmesi üzerine doktora çalışmalarını sürdürmektedir. Bu çerçevede, Tübitak 2244 projesi kapsamında yapay zeka ile omik verilerin entegrasyonu üzerine önemli çalışmalara liderlik etmektedir.
Projeler
*
Yapay Zeka Algoritmaları ile Çoklu Omik Veri Entegrasyonu (yürütücü)
*
Tr.Aqua: Gıda Arzı Güvenliği Çerçevesinde Su Ürünlerinde Yenilikçi ve Sürdürülebilir Uygulamalar
*
Agrigenomics Hub – Animal and Plant Genomics Research Innovation Center
*
Antibiyotik direncinin çevresel rezervuarları ve yayılma dinamiğinin araştırılması
*
KMT2A kromozomal yeniden düzenlemeleri içeren klinik örnekkelerde hedefli NGS ile füzyon gen tespiti
Diğer Projeler
Mavi Genom Mikrobiyota Transkriptom İlişkisinin Sürdürülebilir Su Ürünleri ve Gıda Biyoteknolojisi Kapsamında Araştırılması
Yayınlar
Adapting nature's own solution: The effect of rhamnolipid and lytic bacteriophage cocktail on enteric pathogens that proliferate in mucilage
B Kaşkatepe, HB Erol, VZ Sönmez, M Arikan, EM Unal, E Keskin, N Sivri Marine Pollution Bulletin 206, 116810