Mikrobiyom Çalışma Grubu
Araştırmacılar:
#Mikrobiyom #MikrobiyalTopluluklar #EkosistemSağlığı #Biyoteknoloji #GenetikAnaliz #eDNA #GıdaGüvenliği #MetagenomikDizileme #FonksiyonelGenProfilleme #MikrobiyalÇeşitlilik #EkstremÇevreler #YeniEnzimler #ArkeTürleri #AdaptasyonMekanizmaları #MikrobiyalEkoloji #YerelVeriTabanları #SürdürülebilirÇevre #ÇevreYönetimi #Biyoçeşitlilik #BiyoteknolojikYenilikler
Mikrobiyom Çalışma Grubu, farklı ekosistemlerdeki mikrobiyal toplulukların yapısını ve işlevini inceleyerek ekolojik ve biyoteknolojik yenilikler geliştirmeyi amaçlamaktadır. Grup, insan, bitki, hayvan ve çevresel mikrobiyomların genetik analizini yaparak gıda güvenliği, ekosistem sağlığı ve biyoteknolojik ürün geliştirme gibi geniş bir araştırma yelpazesine katkı sağlamaktadır.
Grubun çalışmalarında, mikrobiyomun ekosistem işlevleriyle olan ilişkisini, çevresel stres faktörlerine tepkilerini ve evrimsel süreçlerle nasıl şekillendiğini anlamaya yönelik disiplinler arası yaklaşımlar benimsenmektedir. Bu kapsamda, mikrobiyal çeşitlilik, topluluk etkileşimleri, fonksiyonel potansiyel ve konak-mikrobiyom ilişkileri gibi konulara odaklanılmaktadır. Özellikle ekstrem çevresel koşullarda yaşayan mikrobiyal toplulukların genetik çeşitliliğinin belirlenmesi, yeni enzim kaynaklarının keşfi, bilinçsiz üretimle tükenen tarım topraklarında çeşitli besin döngülerine katkı sağlayan mikroorganizmaların belirli fonksiyonlarının gen yolaklarının ve biyoteknolojik potansiyellerinin araştırılması grubun önemli odak noktalarından biridir. Türkiye’de az çalışılmış olan arke ve bakteri türlerinin biyoçeşitliliğini ve adaptasyon mekanizmalarını inceleyerek mikrobiyal ekoloji alanına özgün katkılar sunmayı hedefleyen grup, metagenomik dizileme, mikrobiyal çeşitlilik analizi ve fonksiyonel gen profilleme gibi ileri düzey biyoteknolojik araçlar kullanmaktadır. Grup, yerel genetik veri tabanları oluşturarak çevresel DNA (eDNA) temelli mikrobiyal izleme projeleriyle ekosistem dinamiklerini anlamayı ve sürdürülebilir çevre yönetimi stratejileri geliştirmeyi hedeflemektedir.
Çalışma alanı listesi
Mikrobiyal Çeşitlilik Analizi
Örneklerdeki mikrobiyal topluluk yapısının belirlenmesi
Mikrobiyomun Potansiyel Fonksiyonunun Belirlenmesi
Fonksiyonel gen tahmini ve metabolik yolak analizleri
Topluluk Etkileşimleri ve Mikrobiyal Ağ Analizleri
Mikroorganizmaların çevre ve kendi aralarındaki ilişkinin belirlenmesi
Konak-Mikrobiyom İlişkileri
Konak mikrobiyomunun belirlenmesi ve etkieşimlerinin incelenmesi
Çevre İzleme Çalışmaları
Mikrobiyal göstergeler ve indikatör türler ile ekosistem sağlığının değerlendirilmesi
Evrimsel Mikrobiyoloji
Mikrobiyal genom evrimi ve filogenetik analizler
Projeler
Mavi Genom: Mikrobiyota-Transkriptom İlişkisinin Sürdürülebilir Su Ürünleri ve Gıda Biyoteknolojisi Kapsamında Araştırılması
Mikroplastiklerin Biyofilm Patojenitelerinin Araştırılması: Hidrodinamik Taşınım Modelleri ile Çevresel Risk Analizi
Yapay Zeka Algoritmaları ile Çoklu Omik Veri Entegrasyonu
Türkiye'de İnsan İlişkisi Muhtemel Yarasa Türlerinde Virom Profilinin Araştırılması
Yayınlar
Revealing the microbiome of four different thermal springs in Turkey with environmental DNA Metabarcoding, doi:10.3390/biology11070998